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篇1：DNA单链二级结构预测与单链构象多态性分析的一致性研究
DNA单链二级结构预测与单链构象多态性分析的一致性研究
单链构象多态性(SSCP)分析是一种简便,快速检测DNA突变的方法,它在基因突变检测、遗传分析、进化研究等领域有着广泛的应用价值.但是这种方法的突变检出率随DNA序列不同而变化,一般只能达到70%～80%.这主要是有的碱基突变对单链DNA的构象影响较小,不能通过SSCP检测出来.将计算机对DNA二级结构的预测结果和实验结果作了对比,发现二者有很高的一致性.这一结果表明计算机的.DNA单链二级结构预测分析可用于PCR-SSCP分析的辅助设计,提高SSCP的突变检出率.
作 者：何云刚 谭德勇 钱伟 赖建华 谢咏芳 作者单位：云南大学生物技术系,昆明,650091 刊 名：生物化学与生物物理进展 ISTIC SCI PKU英文刊名：PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 年，卷(期)： 28(6) 分类号：Q319.3 关键词：突变检测 DNA单链二级结构预测 单链构象多态性分析学科分类号Q319.3篇2：中继卫星单址链路调度模型与算法研究
中继卫星单址链路调度模型与算法研究
中继卫星的任务规划与调度是空间资源管理的重要内容之一,目的在于为中继卫星系统的任务计划编制提供科学合理的决策手段与依据.中继卫星单址链路调度问题的重要特点在于,中继卫星与用户航天器之间并非时时可见,因此通信任务存在可见时间窗口约束.只有在可见时间窗口内,通信任务才可能执行并完成.在进行合理假设的.基础上,建立中继卫星单址链路调度问题的约束规划模型.对基本遗传算法进行改进,提出了基于有效基因路径表示的改进遗传算法.应用结果表明,基于约束规划理论建立中继卫星单址链路调度模型并采用基于有效基因路径表示的遗传算法求解是合理的.
作 者：陈英武 方炎申 顾中舜 Chen Yingwu Fang Yanshen Gu Zhongshun 作者单位：国防科学技术大学,长沙410073 刊 名：中国空间科学技术 ISTIC PKU英文刊名：CHINESE SPACE SCIENCE AND TECHNOLOGY 年，卷(期)： 27(2) 分类号：P1 关键词：遗传算法 调度 约束规划 跟踪与数据 中继卫星篇3：短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象
短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象
BmK38是最近从东亚钳蝎(Buthus martensi Karsch,BmK)中分离纯化得到的一种短链蝎毒素.应用2D-NMR技术研究 BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1H-NMR谱,识别了 BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系,并通过分析NOESY谱图中daN、dNN、dβN的联系,完成了序列专一性谱峰归属,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的'化学位移.根据谱峰归属的结果和NMR数据分析了 BmK38的二级结构组成并且计算出 BmK38的溶液构象.结构计算的结果与前述二级结构的分析是一致的.结果表明,肽段Gln8～Arg17形成 a 螺旋,而肽段Gly22～Glu29以及Leu32～CYS39构成反平行的β折叠,属于典型的短链蝎毒素的折叠形式.通过与其他 a-KTx短链蝎毒素的结构比较,讨论了 BmK38的结构特异性以及结构功能的相互关系.
作 者： 作者单位： 刊 名：中国科学技术大学学报 ISTIC PKU英文刊名：JOURNAL OF UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY OF CHINA 年，卷(期)： 36(7) 分类号：Q71 关键词：短链蝎毒素 二维核磁共振 序列专一性归属 二级结构 溶液构象篇4：单链抗体及重组白介素-2双功能抗体融合蛋白的表达及其软件预测
单链抗体及重组白介素-2双功能抗体融合蛋白的表达及其软件预测
目的 利用生物信息学网络资源分析融合蛋白的.二级结构及其理化性质,并探讨分泌型抗成骨肉瘤单链双功能抗体基因的表达.方法 采用聚合酶链式反应(PCR)将人工合成的抗体分泌信号肽序列加在抗成骨肉瘤单链抗体(scFv)基因5′端,其3′与白介素-2(IL-2)基因连接构成分泌型单链双功能抗体scFv- IL-2基因,将该基因克隆至逆转录病毒表达载体PLxSN,重组质粒pL(scFv- IL-2)SN在脂质体介导下转染PA317包装细胞,G418筛选,直至出现抗性克隆,扩大培养,用NIH3T3测定病毒滴度,将重组病毒感染人成骨肉瘤细胞命名为OSC/scFv-IL-2,以PCR,RT-PCR以及Western blotting 对scFv-IL-2基因修饰的OSC9901细胞进行鉴定.在构建融合蛋白之后,运用DNA分析软件DNAssist和蛋白质分析软件ANTHEPROT V5分析融合蛋白的氨基酸序列、二级结构及其理化性质.结果 经酶切、PCR及Western blotting分析鉴定,成功地构建了融合基因表达载体pL(scFv- IL-2)SN,并获得高滴度产毒细胞株C26,scFv-IL-2融合蛋白通过DNAssist和ANTHEPROT V5软件分析获得了融合蛋白的二级结构及其理化性质.结论 利用生物信息学网络资源进行分析预测融合蛋白的性质,为进一步探讨单链双功能抗体基因融合蛋白提供依据.
作 者：史梦远 王海涛 张芳琳 SHI Meng-yu WANG Hai-tao ZHANG Fang-li 作者单位：第四军医大学基础部微生物教研室,陕西,西安,710032 刊 名：新乡医学院学报 ISTIC英文刊名：JOURNAL OF XINXIANG MEDICAL COLLEGE 年，卷(期)： 25(2) 分类号：Q782 关键词：单链抗体 生物信息学资源 融合蛋白篇5：抗CEA单链抗体与链亲和素融合基因的表达
抗CEA单链抗体与链亲和素融合基因的表达
克隆分泌CEA杂交瘤细胞重链可变区(VH)和轻链可变区(VL),以Linker连接VH及VL构建抗CEA单链抗体.同时以Spacer连接单链抗体和链亲和素,构建成功单链抗体和链亲和素融合基因,克隆该融合基因至原核表达载体,pET21a(+),经IPTG诱导表达出该双特异性融合蛋白.活性鉴定表明该融合蛋白具有结合CEA及生物素的双特异性.该融合蛋白在生物领域中有较广阔的应用前景.
作 者：任军 季万胜 周绍娟 陈峥 张学庸 樊代明 REN Jun JI Wan-Sheng ZHOU Shao-Juan CHEN Zheng ZHANG Xue-Yong FAN Dai-Ming 作者单位：任军,REN Jun(第四军医大学西京医院肿瘤中心,西安,710032)季万胜,周绍娟,陈峥,张学庸,樊代明,JI Wan-Sheng,ZHOU Shao-Juan,CHEN Zheng,ZHANG Xue-Yong,FAN Dai-Ming(第四军医大学西京医院消化内科,西安,710032)
刊 名：生物化学与生物物理进展 ISTIC SCI PKU英文刊名：PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 年，卷(期)： 27(4) 分类号：Q786 关键词：单链抗体 融合蛋白 基因表达篇6：抗人精浆蛋白/抗CD3双特异性单链抗体的活性研究
抗人精浆蛋白/抗CD3双特异性单链抗体的活性研究
目的: 构建并表达抗人精浆蛋白/抗CD3的双特异性单链抗体(BsscFv),并检测其生物学活性.方法: 利用重叠延伸拼接PCR,拼接抗人精浆蛋白scFv基因和抗CD3 scFv基因,并在中间引入柔性短肽(GlySerGly)2,构建抗人精浆蛋白/抗CD3的BsscFv基因.测序正确后,将融合基因亚克隆入真核表达载体中,并在HeLa细胞中进行表达,采用流式细胞术(FCM)和 51Cr释放试验,评价BsscFv的抗原结合活性和体外介导的特异性杀伤靶细胞的效应,以及利用裸鼠前列腺癌模型观察其在体内的抑瘤作用.结果: 测序分析证实,BsscFv基因片段的大小为1.5 kb,编码500个氨基酸,该序列与设计的完全一致.SDS-PAGE和Western blot分析证明: 表达产物存在于HeLa细胞的培养上清中,其相对分子质量(Mr)为61 000.FCM结果显示: BsscFv可特异性的结合前列腺癌细胞LNCaP和CD3+淋巴瘤细胞Jurkat,结合率分别为54.1%和53.7%.体外实验表明,BsscFv可介导CTL对LNCaP细胞的杀伤.与对照组相比较,接种LNCaP的裸鼠在体内注射激活的.CTL和BsscFv治疗后,肿瘤的生长明显受到抑制(P<0.05).结论: 抗人精浆蛋白/抗CD3的BsscFv具有一定的生物学活性,在体内、体外均可介导CTL杀伤靶细胞LNCaP.
作 者：王栋 王禾 武国军 吴卫真 杨顺良 林文洪 谭建明 WANG Dong WANG He WU Guo-jun WU Wei-zhen YANG Shun-liang LIN Wen-hong TAN Jian-ming 作者单位：王栋,吴卫真,杨顺良,林文洪,谭建明,WANG Dong,WU Wei-zhen,YANG Shun-liang,LIN Wen-hong,TAN Jian-ming(南京军区福州总医院泌尿外科,福建,福州,350025)王禾,武国军,WANG He,WU Guo-jun(第四军医大学西京医院泌尿外科,陕西,西安,710032)
刊 名：细胞与分子免疫学杂志 ISTIC PKU英文刊名：CHINESE JOURNAL OF CELLULAR AND MOLECULAR IMMUNOLOGY 年，卷(期)：2006 22(4) 分类号：Q789 关键词：前列腺肿瘤 CD3 单链抗体 双特异性抗体
